可是，调查刚刚开始不久，犯罪嫌疑人就被人莫名其妙的枪杀了。
犯罪嫌疑人奥斯瓦尔德被人枪杀后，林登.约翰逊总统亲自任命了一个特别委员会负责彻底调查这一谋杀案件。美国首席官厄尔.沃伦是这个委员会的，因此，该委员会也被称为沃伦委员会。他们的调查结果全部收入到《总统特别委员会关于肯尼迪总统被暗杀的调查报告》（即《沃伦报告》）当中。
在长达一个月的调查后，沃伦委员会汇总出上百万字的材料，近二十万字的报告。12月27日，该委员会宣布“在争议和理智的名义下”宣布暗杀总统的“客观真相”：“奥斯瓦尔德纯属个人行为”
这分报告的结论要点如下：1、奥斯瓦尔德是使总统死亡和州长受伤的凶手。
2、子弹从教科书大楼的6层窗口射出。发射的3颗子弹中，一颗也使康纳利州长受伤。
3、没有发现其他人或集团参与了谋杀总统的阴谋。
4、没有发现奥斯瓦尔德为外国服务、受资助、做间谍的证据。
5、没有发现奥斯瓦尔德与美国共产党、古巴正义政策实施委员会、外国工人党合谋谋杀总统的证据。
6、奥斯瓦尔德并非联邦调查局、中央情报局或其他任何部门的探员或职员。
7、没有奥斯瓦尔德与杰克.卢比相识的证据。
8、任何官员都没有参与对美国的密谋或颠覆活动。
奥斯瓦尔德的犯罪动机被归结为：“对一切权威根深蒂固的憎恨以及对马克思主义和共产主义的信仰”结论排除了苏联、古巴插手的可能，也排除了美国及其机构参与的说法。暗杀只是偶然的“意外”，引用联邦调查局的话说：“这从头到尾是美国的一个悲剧一亿九千万美国人中的一个精神状态不稳定的人的个人行为”
然而，谁又能想到，在接下来的调查中，种种迹象却直指时任美国总统的林登.约翰逊！
美国中央情报局老牌特工亨特在1919年年初，预感自己将不久于人世淋巴癌、下巴癌、前列腺癌一齐发作，左腿被迫截肢，记忆力急剧下降，梦也越做越多。他突然意识到，不能就这么把自己知道的一切带进坟墓！为此，他特意打电话给关系一直很僵的大儿子圣约翰，希望他马上回迈阿密看看行将就木的老爹。
当圣约翰风尘仆仆地赶到迈阿密时，老态龙钟的亨特正在起居室里轮椅上看福克斯新闻。他马上让儿子把轮椅推到卧室，扶他上床，然后示意圣约翰去给他倒一杯酒，拿几张纸和一支钢笔来。
圣约翰对老爹亨特谈不上什么感情，亨特当年管教他过于严厉，老妈也死得不明不白，导致圣约翰一度吸毒并两次获罪。此后近20年，父子两人一直没说过什么话。不过，既然老爹开口了，圣约翰还是马上赶回来了，他不知道亨特葫芦里到底卖的什么药。
几个小时后，亨特递给儿子两大页密密麻麻写满字的纸，上面有许多人的名字和对相关事宜的解释。亨特一字一句地说：“这就是副总统林登.约翰逊刺杀肯尼迪的真相！”
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