远在关都地区的小霞因为收到了波克比祭典的邀请函而来到了丰缘地区，和小智一行人约好了见面；小霞进入了所谓的会场，却没想到这是一艘飞艇改装的，马上就起风了。小智一行人也不顾危险强行上了飞艇；他们被带到了一个叫做米拉祖王国的地方，接待他们的人是想要夺走波克比摄政大臣韩佐，之前也是火箭队受雇于他，利用飞艇将大家带来这里。原来韩佐为夺取米拉祖王国的王位和波克比的力量，便雇佣了火箭队为他去捉一只波克比；当他看到和波克比一同前来的小智一行人，他生气地将喵喵扔在了小次郎脸上，并要求小智等人留下波克比离开。小霞拒绝韩佐的要求，韩佐便派出了他的脱壳忍者和铁面忍者攻击了小智等人。面对韩佐的攻势，小智让小霞等人先跑，和明龖留下来应战；小霞、小遥和小胜被脱壳忍者追上，波克比不慎被抛飞。
莎拉公主遇见了掉进喷泉的波克比，她兴奋地带着波克比去找米兰达，并在波克比头上的伤口处贴了胶布。米兰达在浇花的时候得知波克比来到了莎拉公主身边，她便激动地向国王禀报。小霞前来寻找波克比，莎拉公主听见波克比的高兴喊声便知道波克比不是为她而来。当小霞想要向公主索回她的波克比时，米兰达挡在了两人中间并质问小霞是什么人。期间当小霞、小遥和小胜来到米拉祖的国王和王后的面前，韩佐便对国王称三人是入侵者，但国王没有相信韩佐，韩佐只能在国王的命令下先行退下。之后，米兰达在国王的命令下为小智一行人准备送他们离开的飞船，而在这期间米兰达告诉几人他们国家王位继承人的使命，而莎拉公主表示她至今都没找到她的波克比，于是小智等人决定帮助莎拉公主，但莎拉公主婉拒了他们；莎拉公主是个优雅温柔的人，她总是为别人担忧，不愿意将无关的人卷入危险。而在小智一行人即将登船离开米拉祖王国时，韩佐又出现阻挠了几人，一个人的野心会去使他做出很多丧心病狂的事情。
后来当波克比突然向着空中的海市蜃楼飞去时，米兰达猜测波克比可能是感应到海市蜃楼另一边的波克比的乐园；面对韩佐脱壳忍者和两只铁面忍者的强有力攻击，波克比自行发出神秘守护保护了大家，并且带着大家一起去了波克比的乐园。波克比的乐园位于米拉祖王国海市蜃楼的另一边，米拉祖王国一直是守护着这里的家园，两者之间一直维持着平衡；这里出生的波克比通过和地上的人们心灵接触而成长，100年结束还会回来这个乐园，女仆和前任国王就来过这里。
米拉祖王国是位于丰缘地区的王国，坐落在沙漠的另一边，被称为梦幻王国，虽然王国位于丰缘地区，米拉祖王国显然是宝可梦国家政治之外的君主主权国家，类似一些微型国家，如新加坡、摩纳哥和梵蒂冈，就是还有国王的那种国家。一位国王和王后统治这个王国，国民崇拜波克比，这里也有波克比的神殿，一个人需要有一只波克比才能获得到王权。
众人来到了海市蜃楼中的波克比的乐园，但是大家很快就发现波克比乐园变得十分荒芜，连里面的波克比们也十分虚弱，这一切都是因为摄政大臣韩佐心术不正而影响了里面的环境。韩佐在看到小智等人和莎拉公主以及米兰达一起进入了波克比的乐园便带着火箭队来到神殿，他让脱壳忍者和铁面忍者将能力集中在一个焦点上以破坏时空打开联通波克比的乐园的门。韩佐企图强行打开通往波克比乐园的门，小霞的波克比为了保护乐园，就从时空之门回到现实世界，里面的大家却无法离开，也是有点“无敌”的设定，都是剧情的套路。
波克比从门中出现，韩佐就转而让他的宝可梦攻击波克比，并带着受伤的波克比指挥卫兵将国王和王后关进大牢；之后，他决定即刻在神殿举行登基仪式，并让脱壳忍者和铁面忍者赶走了火箭队，从而让火箭队倒戈，装扮成占卜师帮助小智一行人，告诉了他们国王和王后被关押的地方。在举行仪式时，他被小智等人干扰，于是他又想让脱壳忍者和铁面忍者攻击他们，但两只铁面忍者都被皮卡丘用打雷击败，而脱壳忍者的招式则一再被乐园中的波克比用神秘守护挡下，并最后被暴鲤龙用喷射火焰击败。这时国王和王后赶来，韩佐被两人带来的卫兵抓了起来。韩佐的野心很大、言而无信，他妄图利用波克比的力量改变米拉祖王国，他的图谋不轨甚至影响到了波克比的乐园。在离开乐园后，莎拉公主发现韩佐即将夺取王位，她很担心自己的父母，而米兰达让她保持镇定，依靠火箭队的助攻（总是又做了一回好事），国王和王后很快就被救出。
莎拉公主和小智、小霞、小遥来到神殿阻止韩佐，却被脱壳忍者用日光束攻击，这时乐园中的波克比纷纷出现并使用神秘守护保护了四人。莎拉公主很担心波克比的安危便催促它们回到乐园，但在看到小霞的波克比进化成波克基古并和乐园的波克比一起防守住脱壳忍者的招式后，她站出来告诉韩佐守护一切的心才是波克比力量的来源。而在韩佐的阴谋被挫败后，莎拉公主终于遇到了属于她的波克比。这个过程中小霞的波克比进化成波克基古，最后小霞也同意了波克基古的请求，让波克基古留在米拉祖王国来保护王国还有海市蜃楼里的波克比。
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